最后清理的是神宗朱翊钧的棺椁。朱翊钧的棺椁最大，长3.3米，高1.8米，棺内除他的尸体外，塞满了各种陪葬品。他最上层盖的是织锦被，被下放着袍服和织饰匹料，尸体下垫着一条锦被，被下还垫着9层被褥，其中一件褥上缝缀“吉祥如意”金钱17枚。万历帝身着刺绣衮服，腰系玉带，头戴乌纱翼善冠，下身穿黄素绫裤，足蹬红素缎高绣靴。万历帝尸体亦腐烂，仅存骨骼。
价值连城的出土文物
除棺椁内的随葬品外，棺椁外的随葬品也十分丰富，帝后的棺椁附近有29个朱漆木箱，箱内装满了金银器、冠、带、佩、饰、铜锡明器、武器、谥册、谥宝和木俑等物，共计2648件，其中不少珍品均属首见。金器有数百件，其中以帝后的金冠、金酒注、金爵杯尤为精美。朱翊钧的金丝翼善冠，全用极细的金丝，采用多种工艺编织而成，且堆垒出二龙戏珠图案，孔眼匀称，外表不露任何接头痕迹，尤其是龙的造型生动有力，气势雄浑。出土的皇后凤冠有四顶，孝端皇后的一顶上有三龙两凤，龙是金制，龙口衔珠宝，左右两龙各衔长串珠结，凤口衔珠滴，凤上满饰翠云，这翠云是将翠鸟的缘羽攒点在硬纸上，此点翠的方法没有流传下来。冠的里面是用漆竹丝做的圆锥，边缘上镶着金制口圈。另三顶是十二龙九凤冠、九龙九凤冠、六龙三凤冠，这六龙三凤冠最为精美，六条用金丝编织的龙雄踞居于凤冠上，昂首欲腾；三只用翠鸟羽毛粘贴的凤屈居于下，展翅若飞。龙、凤均口衔珠宝串饰，在满饰大小不同的用珍珠宝石缀编的牡丹花及点翠的如意云及花树之间穿行嬉戏。冠后的六扇博鬓，左右分开，如五彩缤纷展开的凤尾。此凤冠珠光宝气，富丽堂皇，共有红、蓝宝石128块，珍珠5400多颗，重2905克。据《明史·舆服志》记载，明永乐三年定制，皇后礼服，其冠九龙四凤，而定陵出土的凤冠龙凤数量与史料记载不同，这对研究明代典章制度很有价值。
