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就在沃罗贝留在医院接受治疗的时候，汉密尔顿和乔伊也在丛林里陷入了困境，他们陷入了蚊子和军蚁的包围之中。身长2.5厘米的军蚁令人望而生畏，而当它们成群结队的过来时更令人胆战心惊。有一次成千上万只军蚁侵入了他们的宿营之地，他们只能靠在周围烧上一圈火才得以击退它们的进攻。
军蚁虽然可怕，而蚊子更令他们防不胜防。更严重的是，这些蚊子身上还带着疟原虫。汉密尔顿和乔伊都没有逃过这一劫。63岁的汉密尔顿考察还没有结束就已经疟疾发作，回到英国后不久就因为并发症而去世。而相对来说年轻的乔伊要幸运一些，几个月后他因为疟疾发起了高烧，但时间不长就康复了。
采集样本也不是一件容易的事。黑猩猩晚上一般在树上睡觉，他们就需要找到黑猩猩晚上睡觉的地方，然后就在那旁边宿营。等到第二天早上黑猩猩的排泄物从树上掉落时，他们才能把这些排泄物封存带回。不过相对于需要应付的其它挑战，他们觉得采集样本几乎是最容易的事情了。
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